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0765-0019
Signal, Image, Parole
 

 ARTICLE VOL 32/2-3 - 2015  - pp.287-310  - doi:10.3166/ts.32.287-310
TITRE
Détection de spots avec sélection d’échelle automatique et seuillage adaptatif en microscopie de fluorescence

TITLE
Spot detection with automatic scale selection and adaptive thresholding in fluorescence microscopy

RÉSUMÉ

En imagerie cellulaire, et plus particulièrement en microscopie de fluorescence, la première phase de beaucoup d’analyses consiste à détecter des éléments intra-cellulaires d’intérêt, comme des protéines ou des vésicules. De nombreuses méthodes de détection ont été développées dans ce contexte, mais elles réclament souvent un paramétrage assez fin et ne peuvent pas toujours s’adapter à l’échelle des éléments à détecter. Nous proposons une méthode incluant une sélection d’échelle automatique précise et un seuillage localement adapté. La méthode fournit de plus le support spatial effectif des éléments détectés, qui ne sont pas nécessairement circulaires. Des expérimentations quantitatives sur images simulées montrent les avantages et les meilleures performances de notre méthode. Des résultats sur séquences réelles confirment son intérêt.



ABSTRACT

In live cell and fluorescence microscopy, the first step of the analysis often consists in detecting a large amount of elements (molecules, vesicles). Many detection methods have been developed to this purpose, but they often need a fine tuning stage and cannot automatically fit the object scale. We propose a detection method with an accurate automatic scale selection and a locally adapted thresholding. Moreover, the method provides the spatial support of the detected elements, which are not necessarily circular. Quantitative experiments on synthetic sequences demonstrate the advantages and better performance of our method. Its interest is confirmed by results on real sequences.



AUTEUR(S)
Antoine BASSET, Jérôme BOULANGER, Patrick BOUTHEMY, Charles KERVRANN, Jean SALAMERO

MOTS-CLÉS
microscopie TIRF, détection, sélection d’échelle, seuillage adaptatif.

KEYWORDS
TIRF microscopy, detection, scale selection, adaptive thresholding.

LANGUE DE L'ARTICLE
Français

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